Centos5.2 下安装64位的ifort 和MPICH2并行

 微尘http://free.yes81.net/yes81/view-5135.html

虽然早期在WINDOWS下玩过MPI，不过在LINUX下还是头一糟。以前只是为了学习和摸索RED9而学习过些。这次可是从头开始，一个命令学习，可谓难矣。花了2天半的时间总算弄通了，也大略对LINXU 下的环境的ifrot和MPICH的配置略知一些，并结合其他先行者的资料这里补充和总结。

Centos5.2 已经自带了yum安装包，因此下面的调用和升级包的执行就基于此。

第一品  LINUX 的安装

如果是普通借口的硬盘，直接把安装盘放入运行就可以了。如果是阵列接口，则需要先用软盘做好驱动。在安装界面输入linux dd回车就好了！

Centos 5.2是服务器内核的64位操作系统，可谓功力强大。

安装时候必须选择上F77/F90等开发工具

第二品  安装编译环境：

我在intel网站上下了不进行技术支持的免费11版本，安装过程极其奇怪，无法辨认到操作系统到底是32位还是64位，也不用提示输入license文件。经过多次尝试只好放弃！

最后是其他学生提供了一套10的版本，而且也提供了license文件。初步安装就通过了，感觉顺利过头了。下面就介绍下，安装前的一些准备工作

1、 安装gcc,gfortran：

yum install cpp gcc gcc-c++ gcc-gfortran gcc-objc++ gcc-objc gcc44 libgcc libgfortran libobjc libstdc++ libstdc++-devel

2、 安装支持

yum install   libstdc++.so.5        这个肯定需要执行的，否则ifort安装不了

yum install glibc-devel

3、 安装GCC和C++编译器

yum install gcc* -y

这个命令很偷懒，全部一次安装好C的编译器

第三品  安装icc和ifort：

在Intel网站下载9.1.047版icc（我是没安装，可以不装）和9.1.043版ifort，然后按网站要求申请许可证，并按提示进行安装即可，我都是全部安装的。基本上10版本的ifort安装很方便就完成的。重要一点就是必须先建立ifort的安装目录，并且把lincese文件复制进入对应目录里。

1、 把icc和ifort的路径加入到环境变量中：

把安装目录下bin文件夹中的iccvars.sh和ifortvars.sh拷贝到/etc/profile.d中。

这个很重要，作了就可以进行下面的MPI的配置和MAKE了，否则死都过不去！

2、 卸载

按照说明说的介绍，PDF里有介绍如何卸载的

第四品  配置ssh:

1、 安装ssh

本来是可以不要的， 不过操作起来很简单，就顺手都给安装上了

yum install openssh openssh-server openssh-clients openssh-askpass

2、 编辑/etc/hosts，

这一步我觉得单机并行似乎可以不要，不过以前这么做的，没有问题，所以现在还这么做

加入一行：127.0.0.1 node01

c.启动sshd并自动生成密钥：

/etc/rc.d/init.d/sshd start

加入启动服务：

chkconfig --level 5 sshd on

d.限制其它人连接：两种做法：a.设置iptables，b.编辑/etc/hosts.deny和/etc/hosts.allow，

这两个文件的格式忘掉了，有需要的同学可以查一下。

第五品  重启计算机

第六品  编译mpich2:

1、 在提示符下，执行下面3个命令

export CC=icc  //----如果安装了icc就必须设置这个，否则千万别设置这个了。

export FC=ifort

export F90=ifort

2、 执行环境配置

./configure --prefix=/opt/mpi

3、 执行编译

make

make install

4、 可以归纳的

上面3条命令可以在下面一条完成

./configure --prefix=/opt/mpi -cc=gcc -fc=ifort -f90=ifort  && make && make install

上面编译大约需要几分钟，耐心等待结束。如果出现异常比如提示说C写入等错误，那么就是没有安装icc而却设置了icc的路径

如果有什么需要进行环境或安装目录的变化的也只需要重新执行1-3步就可以了！

5、 把mpich2的安装目录加入到系统变量中：

   vi /etc/profile.d/mpi.sh

   在里面输入：

   export PATH=$PATH:/opt/mpi/bin

   export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/mpi/lib

   然后保存，在插入模式下多按几次ESC键，然后输入:x回车就可以保存了

   再执行次source mpi.sh

6、 配置mpich2环境：

a.root用户

     vi /etc/mpd.conf

     在其中加入：MPD_SECRETWORD=ROOT  用户的密码

     然后保存，并执行chmod 600 mpd.conf

b.普通用户

vi $HOME/.mpd.conf

然后同上操作，注意文件是.mpd.conf，

且密码是用户密码。

修改/etc/hosts.equiv 文件（如果没有就创建该文件），内容如下：

space1

space2

告诉电脑，有哪几台电脑联合作为机群，如果只有一台电脑，则只要输入当前机的名字就可以了

7、 重新启动电脑

8、 启动mpi:

  mpdboot

这个在每次启动电脑后，都需要执行一次的

9、 最简单的MPI运行命令是

mpirun –np N ./program   注意前面有./ 否则可能会说文件不存在,N是同时并发的进程数。

第七品  如何编译程序

编译ifrot 的程序，可以直接使用mpif90 –o  abc  abc.f90  直接编译和连接abc.f90生成执行文件名字abc。

实际上系统已经默认了mpif90、mpif77的执行等同mpiifort,很奇怪，为什么不生成一个mpiifort，也许这只是外挂的程序。

第八品  卸载MPI

/opt/mpi/sbin/mpeuninstall may be used to remove the installation

Installed MPE2 in /opt/mpi

/opt/mpi/sbin/mpeuninstall may be used to remove the installation

参考文章：

下面这个安装过程文件参考了

《双核CPU单机并行环境设置方法》

《SLES10 Linux（kernel-2.6.16.21-0.8）平台下搭建Fortran并行编译环境》

《ubutun804_amd_安装ifc 以及如何并行》